(1) การเลือกอุปกรณ์ มีปัญหาบางประการในการเลือกอุปกรณ์เภสัชกรรม เช่น การเลือกโดยอาศัยประสบการณ์ (โดยไม่มีการคำนวณจริง หรือการคำนวณข้อมูลไม่เพียงพอ) การแสวงหาความก้าวหน้าโดยไม่ไตร่ตรอง และการตรวจสอบข้อมูลทางกายภาพไม่เพียงพอ ซึ่งส่งผลกระทบอย่างร้ายแรงต่อความสามารถในการใช้งานและความคุ้มค่าของอุปกรณ์

(2) การติดตั้งอุปกรณ์และการฝึกอบรม ในกระบวนการติดตั้งอุปกรณ์เภสัชกรรม มักจะให้ความสำคัญกับความคืบหน้าในการก่อสร้าง โดยละเลยคุณภาพการก่อสร้าง ซึ่งส่งผลให้ต้นทุนการบำรุงรักษาอุปกรณ์เพิ่มขึ้นในภายหลัง นอกจากนี้ การฝึกอบรมที่ไม่เพียงพอสำหรับบุคลากรด้านการบำรุงรักษาและการใช้งานอุปกรณ์ยังก่อให้เกิดความเสี่ยงต่อการจัดการและการบำรุงรักษาอุปกรณ์เภสัชกรรมอีกด้วย

(3) การลงทุนไม่เพียงพอในการจัดการและบำรุงรักษาระบบสารสนเทศ ปัจจุบัน แม้ว่าองค์กรหลายแห่งจะให้ความสำคัญอย่างมากกับการจัดการและบำรุงรักษาอุปกรณ์ รวมถึงการจัดการบันทึกการบำรุงรักษาอุปกรณ์และการบันทึกพารามิเตอร์พื้นฐานต่างๆ แต่ก็ยังคงมีปัญหาอยู่บ้าง เช่น ความยากลำบากในการจัดหาข้อมูลการบำรุงรักษาอย่างต่อเนื่อง การขาดข้อมูลรายละเอียดเฉพาะของอุปกรณ์เภสัชกรรมที่มีประสิทธิภาพ เช่น ข้อกำหนด แบบร่าง ฯลฯ ซึ่งทำให้การจัดการ การบำรุงรักษา และการปรับปรุงอุปกรณ์มีความยากลำบากมากขึ้น

(4) ระบบการจัดการ การขาดระบบการจัดการและวิธีการที่มีประสิทธิภาพ ส่งผลให้การจัดการบุคลากรบำรุงรักษาอุปกรณ์เภสัชกรรมไม่เพียงพอ การทำงานของบุคลากรบำรุงรักษาขาดมาตรฐาน กระบวนการจัดการและบำรุงรักษาอุปกรณ์เภสัชกรรมมีอันตรายแฝงอยู่