(1) การเลือกอุปกรณ์ การเลือกอุปกรณ์เภสัชกรรมมีปัญหาบางประการ เช่น การเลือกจากประสบการณ์ (โดยไม่ได้คำนวณจริง หรือคำนวณข้อมูลไม่เพียงพอ) การแสวงหาความก้าวหน้าอย่างมืดบอด และการตรวจสอบข้อมูลทางกายภาพไม่เพียงพอ ซึ่งส่งผลกระทบอย่างร้ายแรงต่อความสามารถในการใช้งานจริงและความคุ้มค่าของอุปกรณ์

(2) การติดตั้งและฝึกอบรมอุปกรณ์ ในกระบวนการติดตั้งอุปกรณ์เภสัชกรรม มักมีการให้ความสำคัญกับความคืบหน้าของการก่อสร้างโดยละเลยคุณภาพการก่อสร้าง ซึ่งนำไปสู่ต้นทุนการบำรุงรักษาอุปกรณ์ที่เพิ่มขึ้นในภายหลัง นอกจากนี้ การฝึกอบรมบุคลากรด้านการบำรุงรักษาและการปฏิบัติงานที่ไม่เพียงพอยังก่อให้เกิดความเสี่ยงต่อการจัดการและการบำรุงรักษาอุปกรณ์เภสัชกรรมอีกด้วย

(3) การลงทุนด้านการจัดการและบำรุงรักษาระบบสารสนเทศยังไม่เพียงพอ ปัจจุบัน แม้ว่าหลายองค์กรจะให้ความสำคัญกับการจัดการและบำรุงรักษาอุปกรณ์ รวมถึงการบันทึกข้อมูลการบำรุงรักษาและพารามิเตอร์พื้นฐานต่างๆ แต่ก็ยังมีปัญหาบางประการ เช่น การให้ข้อมูลการบำรุงรักษาอย่างต่อเนื่องทำได้ยาก การขาดข้อมูลรายละเอียดอุปกรณ์เภสัชกรรมที่มีประสิทธิภาพ เช่น รายละเอียดเฉพาะ แบบร่าง ฯลฯ ซึ่งสิ่งเหล่านี้ล้วนเพิ่มความยากลำบากในการจัดการ บำรุงรักษา และซ่อมแซมอุปกรณ์

(4) ระบบการจัดการ ขาดระบบและวิธีการจัดการที่มีประสิทธิภาพ ส่งผลให้การบริหารจัดการบุคลากรบำรุงรักษาอุปกรณ์ยาไม่เพียงพอ การปฏิบัติงานของบุคลากรบำรุงรักษาขาดมาตรฐาน กระบวนการจัดการและบำรุงรักษาอุปกรณ์ยาทำให้เกิดอันตรายด้านความปลอดภัยแอบแฝง